A Seção de Controle de DST/Aids por meio da articulação com as coordenadorias regionais de saúde (CRS), municípios, parceiros intersetoriais e organizações da sociedade civil tem como diretriz a atenção integral aos usuários. As ações  contemplam desde a promoção e prevenção em saúde até  ao cuidado integral às pessoas vivendo com HIV/Aids (PVHA). A temática IST/Aids transversaliza as demais políticas de saúde considerando as diversidades e populações vulneráveis.