Sete Centros Macrorregionais de Referência (CMR) em Transtorno do Espectro Autista que oferecem suporte técnico e retaguarda assistencial às equipes dos municípios da macrorregião de saúde respectiva no tema do autismo por meio do matriciamento, nas áreas de assistência social, educação e saúde, articulando o trabalho com os Centros Regionais de Referência que compõem a macrorregião de saúde, auxiliando na organização e fortalecimento das redes municipais.

Trinta Centros Regionais de Referência (CRR) em Transtorno do Espectro Autista que atuam em conjunto com os dispositivos de atendimento/acompanhamento às pessoas com autismo na sua região de saúde de referência, a partir da estratégia do matriciamento fomentada pelos Centros Macrorregionais de Referência, e atendem aos casos graves, severos e refratários da região de saúde respectiva, a partir do Protocolo para Atendimento de Casos Graves pelo Centro Regional de Referência em TEA. O atendimento do CRR deve ocorrer de forma articulada com as redes locais do município de origem da pessoa com autismo possibilitando a qualificação destas equipes do território para lidarem com as necessidades destas pessoas e suas famílias de forma resolutiva.

Macro Centro-Oeste: APAE Santa Maria
RS01: Prefeitura Municipal de São Sepé, RS02: APAE Santiago e RS03: Prefeitura Municipal de Quaraí.

Macro Metropolitana: Prefeitura Municipal de Canoas
RS04: Capão da Canoa, RS05: APAE Osório, RS06:Prefeitura Municipal de Igrejinha, RS07: Grupo SEG Hamburgo, RS08: APAE Sapucaia do Sul, RS09: APAE Camaquã e RS10: APAE POA.

Macro Missioneira: Prefeitura Municipal de Santa Rosa
RS11: Prefeitura Municipal de Santo Ângelo, RS12: Prefeitura Municipal de Cruz Alta, RS13: Prefeitura Municipal de Ijuí e RS14: Associação de Pais e Amigos dos Deficientes Auditivos de Santa Rosa.

Macro Norte: Associação Cristã de Deficientes Físicos de Passo Fundo
RS15: APAE Frederico westphalen, RS16: APAE Nonoai, RS17: APAE Passo Fundo, RS18: À construir, RS19: Prefeitura Municipal de Espumoso e RS20: APAE Constantina.

Macro Sul: Prefeitura Municipal de Pelotas
RS21: Prefeitura Municipal de São Lourenço do Sul e RS22: União espírita Bageense Caminho da Luz Bagé.

Macro Serra: APAE Gramado
RS23:Unidade Auditiva Clélia Manfro, RS24: Organização Não Governamental Passo Amigo, RS25: Assossiação dos Pais e Amigos dos Surdos de Paraí e RS26: APAE Feliz.

Macro Vales: Prefeitura Municipal de Cachoeira do Sul
RS27: À construir, RS28:Consórcio Intermunicipal de Serviços do Vale do Rio Pardo - CISVALE Santa Cruz do Sul, RS29:APAE Encantado e RS30: APAE Bom Retiro do Sul.